库珀河是澳大利亚中东部的间歇性内陆河，发源于昆土兰州沃里戈岭北坡的坦博附近，源流叫巴库(Barcoo)河，朝西北流至布莱科尔，然后转向西南方向流至温多拉，接纳其主要支流汤姆森(Thomson)河后称库珀河。库珀河向西南流，穿越南澳大利亚州东北部，最后注入艾尔(Eyre)湖。河流全长1420km，流域位于东经137°41′～146°29′，南纬20°30′～28°29′之间。

汤姆森河是库珀河的最大支流，发源于昆土兰州洛尔沃斯岭南坡，源流名叫托雷斯(Torres)河，向南流接纳布洛克(Bullock)河、陶尔希尔(Towerhill)河和兰兹伯勒(Landsborough)河等支流，在马塔巴拉以下才称为汤姆森河。汤姆森河朝西南流，沿途有阿拉马克(Aramac)河、达尔(Darr)河和弗奇蒙特(Vergemont)河等支流汇入，在温多拉附近注入库珀河。

除汤姆森河之外，库珀河沿途还有艾丽斯(Alice)河、鲍威尔(Powell)河以及威尔逊(Wilson )河等支流汇入。